牡丹鹦鹉小鸟区别雌雄，肉眼无法分辨，繁殖者根据亲鸟品品的遗传基因能区分一部分个体，大部分还是送检测机构进行DNA性别检验。牡丹鹦鹉成年即6个月以后，这时雌雄个体差异可以通过一下方式区分：
1、别草：雌鸟还有一个特殊肢体语言，就是往巢箱里运送巢草不是用喙衔着，而是用喙把巢草插在尾上复羽里，俗称别草，有时能插很多根巢草，非常有趣。当然，用纸箱、树叶、树枝等也有同样的效果。公鸟是不会有这种行为的。这个方式准确度接近100%。
2、嗦食：牡丹鹦鹉公鸟会收缩自己的嗉囊，吐出半消化的食物去喂雌鸟。这个方式判断雌雄的准确度也也挺高，80%左右。因为有时候，两只母鸟也会互相嗦食。
3、踩背：母鸟发情时，对雄鸟做出身体下匐张开翅膀尾羽上竖的举动，表示接受交配，公鸟会踩到雌鸟的背上进行交配。这个方式判断雌雄的准确度也挺高，80%左右。因为有时候，两只母鸟也会互相踩背。
其它的一些方式只能参考参考，都是不准确的。比如：看头型、体型、站杠姿态、用手摸泄殖腔趾骨的宽窄等。大部分牡丹鹦鹉这些特征不明显，往往会出现判断错误。
